概要

研究と設備

教育と学生生活

受験生の方へ(学部/大学院)

Research / Equipment

研究と設備

HOME

研究と設備

研究者紹介

研究者紹介

<戻る

高分子化学分野(化学薬学領域)

吉田 卓也准教授

ヒトの疾患関連タンパク質複合体の構造解析・分子間相互作用解析を通じた創薬研究に取り組んでいます。
専門:構造生物学・生物物理化学・NMR分光学
経歴:1995年 大阪大学大学院理学研究科無機および物理化学専攻博士前期課程修了, 1997年 大阪大学薬学部助手, 2004年 博士(薬学)大阪大学, 2012年より現職

研究テーマ

疾患関連タンパク質の構造生物学

糖尿病、脂質異常症といった生活習慣病や癌などの疾患に関わるタンパク質の立体構造および分子間相互作用を構造生物学・物理化学的な手段を通じて探求し、その機能メカニズム解明に繋がる発見を目指しています。また、タンパク質複合体の立体構造解析やドッキングスタディに基づき、薬剤シード分子のデザインを行います。

NMR及び分子動力学シミュレーションによるタンパク質の動的構造解析

タンパク質の立体構造がもつ揺らぎは、タンパク質の機能発現やリガンド認識に重要です。主にNMR法により、タンパク質分子の動的な構造を実験的に解析すると共に、分子動力学シミュレーションを通じて、ダイナミクスと機能の関連を明らかにしていきます。

代表的な業績

Structural Basis for PPARα Activation by 1H-pyrazolo-[3,4-b]pyridine Derivatives., Yoshida T, Oki H, Doi M, Fukuda S, Yuzuriha T, Tabata R, Ishimoto K, Kawahara K, Ohkubo T, Miyachi H, Doi T, Tachibana K. Sci Rep. 2020;10(1):7623

Spatiotemporal regulation of PEDF signaling by type I collagen remodeling., Kawahara K, Yoshida T, Maruno T, Oki H, Ohkubo T, Koide T, Kobayashi Y. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020;117(21):11450-11458

Ordered self-assembly of the collagenous domain of adiponectin with noncovalent interactions via glycosylated lysine residues., Takuwa A, Yoshida T, Maruno T, Kawahara K, Mochizuki M, Nishiuchi Y, Kobayashi Y, Ohkubo T. FEBS Lett. 2016;590(2):195-201

Structural basis for PPARγ transactivation by endocrine-disrupting organotin compounds., Harada S, Hiromori Y, Nakamura S, Kawahara K, Fukakusa S, Maruno T, Noda M, Uchiyama S, Fukui K, Nishikawa J, Nagase H, Kobayashi Y, Yoshida T, Ohkubo T, Nakanishi T. Sci Rep. 2015;5:8520

Thermodynamic and NMR analyses of NADPH binding to lipocalin-type prostaglandin D synthase., Qin S, Shimamoto S, Maruno T, Kobayashi Y, Kawahara K, Yoshida T, Ohkubo T. Biochem Biophys Res Commun. 2015;468(1-2):234-9

Solution structure of the variable-type domain of the receptor for advanced glycation end products: new insight into AGE-RAGE interaction., Matsumoto S, Yoshida T, Murata H, Harada S, Fujita N, Nakamura S, Yamamoto Y, Watanabe T, Yonekura H, Yamamoto H, Ohkubo T, Kobayashi Y. Biochemistry. 2008 ;47(47):12299-311

X-ray crystallography study on ribosome recycling: the mechanism of binding and action of RRF on the 50S ribosomal subunit., Wilson DN, Schluenzen F, Harms JM, Yoshida T, Ohkubo T, Albrecht R, Buerger J, Kobayashi Y, Fucini P. EMBO J. 2005;24(2):251-60.

NMR structure of transcription factor Sp1 DNA binding domain., Oka S, Shiraishi Y, Yoshida T, Ohkubo T, Sugiura Y, Kobayashi Y. Biochemistry. 2004;43(51):16027-35

Structure and binding mode of a ribosome recycling factor (RRF) from mesophilic bacterium., Nakano H, Yoshida T, Uchiyama S, Kawachi M, Matsuo H, Kato T, Ohshima A, Yamaichi Y, Honda T, Kato H, Yamagata Y, Ohkubo T, Kobayashi Y. J Biol Chem. 2003;278(5):3427-36

Solution structure of the ribosome recycling factor from Aquifex aeolicus., Yoshida T, Uchiyama S, Nakano H, Kashimori H, Kijima H, Ohshima T, Saihara Y, Ishino T, Shimahara H, Yoshida T, Yokose K, Ohkubo T, Kaji A, Kobayashi Y. Biochemistry. 2001;40(8):2387-96