Research / Equipment
研究と設備
研究者紹介
生物有機化学分野（化学薬学領域）
山口 卓男准教授
大阪大学大学院薬学研究科（以下、当研究科）で2008年3月に博士号を取得後、米国ノートルダム大学にて抗菌剤の研究開発に取り組みました。2010年4月からは理化学研究所で細胞死阻害剤に関する研究を行い、2013年2月に当研究科に戻って人工核酸の開発を手掛けました。さらに、2014年4月に東京大学分子細胞生物学研究所に移り、低分子創薬やケミカルバイオロジー研究を展開してきました。当研究科には、2017年4月に戻ってきました。タンパク質や核酸といった生体高分子を有機化学の視点から捉えて、医薬品の開発につながるような研究を展開しています。
研究テーマ
人工核酸の創製とその医薬応用
核酸医薬は、DNAやRNAを標的にできる創薬モダリティであり、画期的な医薬品の開発にも繋がることから近年注目されています。我々は、核酸医薬材料である人工核酸の開発を行なっており、その分子設計から有機合成、医薬物性評価、生物活性評価、安全性評価に至るまで、一連の創薬研究を展開しています。
タンパク質のラベル化・化学修飾
生物活性化合物がどのようなメカニズムで働くかを理解する上で、標的タンパク質の同定が極めて重要になります。我々は、細胞内で生物活性化合物が相互作用するタンパク質を特異的に蛍光ラベル化し、同定する手法の開発を行なっています。また、有機化学をベースとして、タンパク質やペプチドの化学修飾にも取り組んでいます。
核酸医薬やmRNA医薬の分析法開発
核酸医薬品やmRNA医薬品の承認が加速する中、品質を支える分析法の開発も重要になっています。我々は、LC/MSによって目的物質と不純物とを適切に分離分析する手法などを開発しています。また、それらの成果を規制整備へと繋げるべく、発信活動を行っています。
代表的な業績
Development of synthetic routes to 2′-O,4′-C-spirocyclopentylene-bridged nucleic acids: thymidine, guanosine, and adenosine. Chem. Eur. J. 2025, 31, e02995.
Cycloalkane incorporation into the 2′,4′-bridge of locked nucleic acid: enhancing nuclease stability, reducing phosphorothioate modifications, and lowering hepatotoxicity in antisense oligonucleotides. JACS Au 2025, 5, 5111–5120.
Phthalimide: a potential warhead for switchable and bioorthogonal conjugation. Chem. Commun. 2025, 61, 13417–13420.
Separation of deaminated impurities from the desired oligonucleotides using supercritical fluid chromatography. J. Chromatogr. A 2025, 1744, 465731.
Separation of the diastereomers of phosphorothioated siRNAs by anion-exchange chromatography under non-denaturing conditions. J. Chromatogr. A 2024, 1721, 464847.
Mechanism of the extremely high duplex-forming ability of oligonucleotides modified with N-tert-butylguanidine- or N-tert-butyl-N′-methylguanidine-bridged nucleic acids. Nucleic Acids Res. 2023, 51, 7749–7761.
Development of 8–17 XNAzymes that are functional in cells. Chem. Sci. 2023, 14, 7620–7629.
Specific fluorescence labeling of target proteins by using a ligand–4-azidophthalimide conjugate. Chem. Commun. 2017, 53, 8751–8754.
Synthesis and properties of 2′-O,4′-C-spirocyclopropylene bridged nucleic acid (scpBNA), an analogue of 2′,4′-BNA/LNA bearing a cyclopropane ring. Chem. Commun. 2015, 51, 9737–9740.
Turn-ON fluorescent affinity labeling using a small bifunctional O-nitrobenzoxadiazole unit. Chem. Sci. 2014, 5, 1021–1029.
