Research / Equipment
研究と設備
研究者紹介
定量生命物理化学分野（化学薬学領域）
白石 勇太郎特任講師(常勤)
博士(薬科学)
2011年 東京大学薬学部薬科学科卒業
2016年 東京大学大学院薬学系研究科薬科学専攻博士後期課程修了
2016-2017年 日本学術振興会特別研究員(PD)
2017-2018年 バイオ産業情報化コンソーシアム特別研究職員
2018-2019年 東京大学大学院薬学系研究科特任研究員
2019-2020年 バイオ産業情報化コンソーシアム特別研究職員
2020-2024年 理化学研究所生命機能科学研究センター 研究員
2024年より現職
研究テーマ
創薬標的タンパク質の活性制御機構の解明
生体内においてタンパク質は、その構造を柔軟に変化させ、ほかの生体分子と複合体を形成することで機能を発揮する。本研究では、核磁気共鳴(NMR)法をはじめとする各種物理化学的手法を用いることで、創薬標的タンパク質の活性がリガンドやエフェクター分子との相互作用によりどのように制御されるかを、動的構造の観点から明らかとする。
代表的な業績
Shiraishi Y*, Shimada I*. “NMR Characterization of the Papain-like Protease from SARS-CoV-2 Identifies the Conformational Heterogeneity in Its Inhibitor-Binding Site” J. Am. Chem. Soc. (2023) 145, 30, 16669-16677
Shiraishi Y, Kofuku Y, Ueda T, Pandey S, Dwivedi-Agnihotri H, Shukla AK, Shimada I*. “Biphasic actiovation of β-arrestin 1 upon interaction with a GPCR revealed by methyl-TROSY NMR” Nat. Commun. (2021) 12, 7158
Mizumura T, Kondo K, Kurita M, Kofuku Y, Natsume M, Imai S, Shiraishi Y, Ueda T, Shimada I*. “Activation of adenosine A2A receptor by lipids from docosahexaenoic acid revealed by NMR” Sci. Adv. (2020) 6, eaay8544
Imai S, Yokomizo T, Kofuku Y, Shiraishi Y, Ueda T, Shimada I*. “Structural equilibrium underlying ligand-dependent activation of β2-adrenoceptor” Nat. Chem.Biol. (2020) 16, 430-439
Kofuku Y, Yokomizo T, Imai S, Shiraishi Y, Natsume M, Itoh H, Inoue M, Nakata K, Igarashi S, Yamaguchi H, Mizukoshi T, Suzuki EI, Ueda T, Shimada I*. “Deuteration and selective labeling of alanine methyl groups of β2-adrenergic receptor expressed in a baculovirus-insect cell expression system” J Biomol NMR (2018) 71, 185-192
Shiraishi Y, Natsume M, Kofuku Y, Imai S, Nakata K, Mizukoshi T, Ueda T, Iwaï H, Shimada I*. “Phosphorylation-induced conformation of β2-adrenoceptor related to arrestin recruitment revealed by NMR” Nat. Commun. (2018) 9, 194
Okude J, Ueda T, Kofuku Y, Sato M, Nobuyama N, Kondo K, Shiraishi Y, Mizumura T, Onishi K, Natsume M, Maeda M, Tsujishita H, Kuranaga T, Inoue M, Shimada I*. “Identification of a Conformational Equilibrium That Determines the Efficacy and Functional Selectivity of the μ-Opioid Receptor” Angew. Chem. Int. Ed. Engl. (2015) 54, 15771-15776
Kofuku Y, Ueda T, Okude J, Shiraishi Y, Kondo K, Mizumura T, Suzuki S, Shimada I*. “Functional dynamics of deuterated β2-adrenergic receptor in lipid bilayers revealed by NMR spectroscopy” Angew. Chem. Int. Ed. Engl. (2014) 53, 13376-13379
Kofuku Y, Ueda T, Okude J, Shiraishi Y, Kondo K, Maeda M, Tsujishita H, Shimada I*. “Efficacy of the β₂-adrenergic receptor is determined by conformational equilibrium in the transmembrane region” Nat. Commun. (2012) 3, 1045
