Research / Equipment
研究と設備
研究者紹介
生物有機化学分野（化学薬学領域）
山口 卓男講師
大阪大学大学院薬学研究科（以下、当研究科）で2008年3月に博士号を取得後、米国ノートルダム大学にて抗菌剤の研究開発に取り組みました。2010年4月からは理化学研究所で細胞死阻害剤に関する研究を行い、2013年2月に当研究科に戻って人工核酸の開発を手掛けました。さらに、2014年4月に東京大学分子細胞生物学研究所に移り、低分子創薬やケミカルバイオロジー研究を展開してきました。当研究科には、2017年4月に戻ってきました。タンパク質や核酸といった生体高分子を有機化学の視点から捉えて、医薬品の開発につながるような研究を展開しています。
研究テーマ
人工核酸の創製とその医薬応用
核酸医薬は、DNAやRNAを標的にできる創薬モダリティであり、画期的な医薬品の開発にも繋がることから近年注目されています。我々は、核酸医薬材料である人工核酸の開発を行なっており、その分子設計から有機合成、医薬物性評価、生物活性評価、安全性評価に至るまで、一連の創薬研究を展開しています。
タンパク質のラベル化・化学修飾
生物活性化合物がどのようなメカニズムで働くかを理解する上で、標的タンパク質の同定が極めて重要になります。我々は、細胞内で生物活性化合物が相互作用するタンパク質を特異的に蛍光ラベル化し、同定する手法の開発を行なっています。また、有機化学をベースとして、タンパク質やペプチドの化学修飾にも取り組んでいます。
代表的な業績
Synthesis and duplex-forming ability of oligonucleotides modified with 4′-C,5′-C-methylene-bridged nucleic acid (4′,5′-BNA). Bioorg. Med. Chem. 2021, 46, 116359.
Synthesis and properties of oligonucleotides having ethynylphosphonate (EP) linkages. J. Org. Chem. 2020, 85, 1794–1801.
Detection of esterase activity by chromogenic and fluorogenic probe based on an O-nitrobenzoxadiazole (O-NBD) unit. Bioorg. Med. Chem. 2019, 27, 1444–1448.
Hybridization and mismatch discrimination abilities of 2′,4′-bridged nucleic acids bearing 2-thiothymine or 2-selenothymine nucleobase. J. Org. Chem. 2019, 84, 1430–1439.
Specific fluorescence labeling of target proteins by using a ligand–4-azidophthalimide conjugate. Chem. Commun. 2017, 53, 8751–8754.
Synthesis of scpBNA-mC, -A and -G monomers and evaluation of the binding affinities of scpBNA-modified oligonucleotides toward complementary ssRNA and ssDNA. J. Org. Chem. 2016, 81, 11000–11008.
Structure-activity relationship studies of non-carboxylic acid peroxisome proliferator-activated receptor / (PPAR/) dual agonists. Bioorg. Med. Chem. 2016, 24, 5455–5461.
Discovery of N-(1-(3-(4-phenoxyphenyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl)ethyl)acetamides as novel acetyl-CoA carboxylase 2 (ACC2) inhibitors with peroxisome proliferator-activated receptor / (PPAR/) dual agonistic activity. Bioorg. Med. Chem. 2016, 24, 5258–5269.
Synthesis and properties of 2′-O,4′-C-spirocyclopropylene bridged nucleic acid (scpBNA), an analogue of 2′,4′-BNA/LNA bearing a cyclopropane ring. Chem. Commun. 2015, 51, 9737–9740.
Turn-ON fluorescent affinity labeling using a small bifunctional O-nitrobenzoxadiazole unit. Chem. Sci. 2014, 5, 1021–1029.
